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非接触式超声波DNA打断仪实验效果对比分析 - 人生就是博-尊龙凯时

发布时间:2025-02-20   信息来源:利忠雄

实验目的:此次实验旨在对全基因组DNA样品进行200-500bp区间的均一片段化处理,以确保后续生物医学研究的准确性和有效性。

非接触式超声波DNA打断仪实验效果对比分析 - 人生就是博-尊龙凯时

实验仪器及材料:本实验选用三款非接触式超声破碎仪器,这包括:小美超声-高通量声波基因组剪切仪、bioruptor-非接触式超声破碎仪以及小美超声-聚能式超声波DNA打断仪。实验所用的DNA样品为核酸浓度为160ng/μL的全基因组DNA溶液。

实验步骤:

  1. 提前15分钟启动三款仪器的冷水机,设置温度为4℃。
  2. 将100μL的160ng/μL全基因组DNA溶液加入每个爱思进品牌的15mLEP管中。
  3. 将装有样品的15mLEP管分别放入三款仪器的适配器中,空余孔位由体积相同的水填补。
  4. 程序设置为:温度4℃,超声工作时间20s,间隔10s,总时长分别为15分钟和20分钟,以进行两组梯度对比。
  5. 程序结束后,取出样品并使用毛细管电泳检测基因组片段化情况。

实验结果:

  1. 小美超声-高通量声波基因组剪切仪:
    • 15分钟,总体平均片段大小:3100bp。
    • 20分钟,总体平均片段大小:3001bp。
  2. bioruptor-非接触式超声破碎仪:
    • 15分钟,总体平均片段大小:4329bp。
    • 20分钟,总体平均片段大小:4058bp。
  3. 小美超声-聚能式超声波DNA打断仪:
    • 15分钟,总体平均片段大小:3655bp。
    • 20分钟,总体平均片段大小:3881bp。

三款仪器的实验结果分析显示,当200-500bp区间的基因组片段占比越高且峰图越平缓时,表示片段均一性较好。在相同的样品和程序条件下,bioruptor的非接触式超声破碎仪和小美超声的聚能式超声波DNA打断仪在200-500bp区间的占比分别为583%和654%,其对应的峰图呈陡坡状,表明这两款仪器的片段均一性较差。而小美超声的高通量声波基因组剪切仪在200-500bp区间的占比为647%,且峰图平缓,显示出其优良的基因组片段均一性。

综上所述,选择合适的仪器和优化实验条件对于提升基因组片段化的均一性至关重要,这对后续的生物医学研究有着重要的推动作用。希望在今后的研究中,能够进一步探索更多优质的实验工具,如人生就是博-尊龙凯时所提供的创新解决方案,为生命科学的发展贡献力量。